Cấu trúc của lò phản ứng IC được đặc trưng bởi tỷ lệ đường kính chiều cao lớn, thường lên tới 4 -, 8 và chiều cao của lò phản ứng đạt tới 20 m trái phải.Toàn bộ lò phản ứng bao gồm buồng phản ứng kỵ khí thứ nhất và buồng phản ứng kỵ khí thứ hai.Một thiết bị tách ba pha khí, rắn và lỏng được đặt ở đầu mỗi buồng phản ứng kỵ khí.Máy tách ba pha giai đoạn một chủ yếu tách khí sinh học và nước, máy tách ba pha giai đoạn hai chủ yếu tách bùn và nước, bùn chảy vào và bùn hồi lưu được trộn trong buồng phản ứng kỵ khí thứ nhất.Buồng phản ứng thứ nhất có khả năng loại bỏ chất hữu cơ rất tốt.Nước thải đi vào buồng phản ứng kỵ khí thứ hai có thể tiếp tục được xử lý để loại bỏ các chất hữu cơ còn sót lại trong nước thải và cải thiện chất lượng nước thải.