Konštrukcia IC reaktora sa vyznačuje veľkým pomerom výšky priemeru, všeobecne až 4 -, 8, a výška reaktora dosahuje 20 m vľavo vpravo.Celý reaktor sa skladá z prvej anaeróbnej reakčnej komory a druhej anaeróbnej reakčnej komory.V hornej časti každej anaeróbnej reakčnej komory je umiestnený trojfázový separátor plynu, pevnej látky a kvapaliny.Trojfázový separátor prvého stupňa oddeľuje hlavne bioplyn a vodu, trojfázový separátor druhého stupňa hlavne oddeľuje kal a vodu a pritekajúci a refluxný kal sa mieša v prvej anaeróbnej reakčnej komore.Prvá reakčná komora má veľkú schopnosť odstraňovať organické látky.Odpadová voda vstupujúca do druhej anaeróbnej reakčnej komory môže byť ďalej čistená, aby sa odstránili zvyšné organické látky v odpadovej vode a zlepšila sa kvalita odpadovej vody.