A estrutura do reator IC é caracterizada por uma grande proporção de altura e diâmetro, geralmente de até 4 -, 8, e a altura do reator atinge 20 m à esquerda e à direita.Todo o reator é composto por uma primeira câmara de reação anaeróbica e uma segunda câmara de reação anaeróbica.Um separador trifásico de gás, sólido e líquido é colocado no topo de cada câmara de reação anaeróbica.O separador trifásico de primeiro estágio separa principalmente biogás e água, o separador trifásico de segundo estágio separa principalmente lodo e água, e o lodo influente e de refluxo são misturados na primeira câmara de reação anaeróbica.A primeira câmara de reação possui grande capacidade de remoção de matéria orgânica.As águas residuais que entram na segunda câmara de reação anaeróbica podem continuar a ser tratadas para remover a matéria orgânica restante nas águas residuais e melhorar a qualidade do efluente.