De structuur van de IC-reactor wordt gekenmerkt door een grote hoogtediameterverhouding, in het algemeen tot 4 -, 8, en de hoogte van de reactor bereikt 20 links m rechts.De gehele reactor bestaat uit een eerste anaërobe reactiekamer en een tweede anaërobe reactiekamer.Bovenaan elke anaerobe reactiekamer is een driefasenscheider voor gas, vaste stof en vloeistof geplaatst.De driefasenscheider van de eerste fase scheidt voornamelijk biogas en water, de driefasenscheider van de tweede fase scheidt voornamelijk slib en water, en het influent en het refluxslib worden gemengd in de eerste anaerobe reactiekamer.De eerste reactiekamer heeft een groot vermogen om organisch materiaal te verwijderen.Het afvalwater dat de tweede anaerobe reactiekamer binnenkomt, kan verder worden behandeld om het resterende organische materiaal in het afvalwater te verwijderen en de effluentkwaliteit te verbeteren.