आईसी रिएक्टरको संरचना ठूलो उचाइ व्यास अनुपात द्वारा विशेषता हो, सामान्यतया 4 -, 8 सम्म, र रिएक्टरको उचाइ 20 बायाँ मिटर दायाँ पुग्छ।सम्पूर्ण रिएक्टर पहिलो एनारोबिक प्रतिक्रिया कक्ष र दोस्रो एनारोबिक प्रतिक्रिया कक्ष मिलेर बनेको छ।प्रत्येक एनारोबिक प्रतिक्रिया कक्षको शीर्षमा ग्यास, ठोस र तरल तीन-चरण विभाजक सेट गरिएको छ।पहिलो चरणको थ्री-फेज सेपरेटरले मुख्यतया बायोगास र पानीलाई अलग गर्छ, दोस्रो चरणको थ्री-फेज सेपरेटरले मुख्यतया स्लज र पानीलाई अलग गर्छ, र इन्फ्लुएन्ट र रिफ्लक्स स्लजलाई पहिलो एनारोबिक प्रतिक्रिया कक्षमा मिसाइन्छ।पहिलो प्रतिक्रिया कक्षमा जैविक पदार्थ हटाउने ठूलो क्षमता हुन्छ।दोस्रो एनारोबिक प्रतिक्रिया कक्षमा प्रवेश गर्ने फोहोर पानीलाई फोहोर पानीमा बाँकी रहेको जैविक पदार्थ हटाउन र प्रवाहको गुणस्तर सुधार गर्न प्रशोधन गर्न जारी राख्न सकिन्छ।