IC अणुभट्टीची रचना मोठ्या उंचीच्या व्यासाच्या गुणोत्तराद्वारे दर्शविली जाते, साधारणपणे 4 -, 8 पर्यंत, आणि अणुभट्टीची उंची 20 डाव्या मीटर उजवीकडे पोहोचते.संपूर्ण अणुभट्टी हा पहिला अॅनारोबिक रिअॅक्शन चेंबर आणि दुसरा अॅनारोबिक रिअॅक्शन चेंबर बनलेला असतो.प्रत्येक अॅनारोबिक रिअॅक्शन चेंबरच्या शीर्षस्थानी एक वायू, घन आणि द्रव थ्री-फेज सेपरेटर सेट केला जातो.पहिला टप्पा थ्री-फेज सेपरेटर प्रामुख्याने बायोगॅस आणि पाणी वेगळे करतो, दुसरा टप्पा थ्री-फेज सेपरेटर प्रामुख्याने गाळ आणि पाणी वेगळे करतो आणि इन्फ्लुएंट आणि रिफ्लक्स स्लज पहिल्या अॅनारोबिक रिअॅक्शन चेंबरमध्ये मिसळले जातात.पहिल्या प्रतिक्रिया कक्षामध्ये सेंद्रिय पदार्थ काढून टाकण्याची उत्तम क्षमता असते.दुस-या अॅनारोबिक रिअॅक्शन चेंबरमध्ये प्रवेश करणा-या सांडपाण्यावर सांडपाण्यातील उरलेले सेंद्रिय पदार्थ काढून टाकण्यासाठी आणि प्रवाहाची गुणवत्ता सुधारण्यासाठी प्रक्रिया केली जाऊ शकते.