IC реакторының құрылымы үлкен диаметрлі биіктік қатынасымен сипатталады, әдетте 4 -, 8-ге дейін, ал реактордың биіктігі оңға қарай 20 м-ге жетеді.Бүкіл реактор бірінші анаэробты реакция камерасынан және екінші анаэробты реакция камерасынан тұрады.Әрбір анаэробты реакция камерасының жоғарғы жағында газ, қатты және сұйық үш фазалы сепаратор орнатылған.Бірінші сатыдағы үш фазалы сепаратор негізінен биогаз мен суды, екінші сатыдағы үш фазалы сепаратор негізінен лай мен суды бөледі, бірінші анаэробты реакция камерасында ағынды және ағынды шламды араластырады.Бірінші реакциялық камераның органикалық заттарды кетіру қабілеті зор.Екінші анаэробты реакция камерасына түсетін ағынды суды ағынды судағы қалған органикалық заттарды жою және ағынды сулардың сапасын жақсарту үшін тазартуды жалғастыруға болады.