המבנה של כור IC מאופיין ביחס קוטר גובה גדול, בדרך כלל עד 4 -, 8, וגובה הכור מגיע ל-20 מ' שמאל ימינה.הכור כולו מורכב מתא תגובה אנאירובית ראשונה ותא תגובה אנאירובית שני.מפריד תלת פאזי גז, מוצק ונוזל מוגדר בחלק העליון של כל תא תגובה אנאירובית.המפריד התלת-פאזי השלב הראשון מפריד בעיקר ביו-גז ומים, המפריד התלת-פאזי השלב השני מפריד בעיקר בין בוצה ומים, ובוצת השפע והריפלוקס מעורבבים בתא התגובה האנאירובי הראשון.לתא התגובה הראשון יש יכולת מצוינת להסיר חומרים אורגניים.ניתן להמשיך ולטפל בשפכים הנכנסים לתא התגובה האנאירובי השני כדי להסיר את החומר האורגני שנותר בשפכים ולשפר את איכות הקולחים.