Struktur reaktor IC dicirikan oleh rasio diameter tinggi yang besar, umumnya mencapai 4 -, 8, dan tinggi reaktor mencapai 20 kiri m kanan.Seluruh reaktor terdiri dari ruang reaksi anaerobik pertama dan ruang reaksi anaerobik kedua.Pemisah tiga fase gas, padat dan cair dipasang di bagian atas setiap ruang reaksi anaerobik.Pemisah tiga fase tahap pertama terutama memisahkan biogas dan air, pemisah tiga fase tahap kedua terutama memisahkan lumpur dan air, dan lumpur influen dan refluks dicampur dalam ruang reaksi anaerobik pertama.Ruang reaksi pertama memiliki kemampuan besar untuk menghilangkan bahan organik.Air limbah yang masuk ke ruang reaksi anaerobik kedua dapat terus diolah untuk menghilangkan sisa bahan organik dalam air limbah dan meningkatkan kualitas limbah.