Strukturen af IC-reaktoren er kendetegnet ved et stort højdediameterforhold, generelt op til 4 -, 8, og reaktorens højde når 20 venstre m til højre.Hele reaktoren er sammensat af et første anaerobt reaktionskammer og et andet anaerobt reaktionskammer.En gas-, faststof- og flydende trefaseseparator er sat i toppen af hvert anaerobt reaktionskammer.Trefaseseparatoren i første trin adskiller hovedsageligt biogas og vand, anden trins trefaseseparator adskiller hovedsageligt slam og vand, og indløbs- og tilbagesvalingsslam blandes i det første anaerobe reaktionskammer.Det første reaktionskammer har stor evne til at fjerne organisk stof.Spildevandet, der kommer ind i det andet anaerobe reaktionskammer, kan fortsætte med at blive behandlet for at fjerne det resterende organiske stof i spildevandet og forbedre spildevandskvaliteten.