Konstrukce IC reaktoru se vyznačuje velkým poměrem výšky a průměru, obecně až 4 -, 8, a výška reaktoru dosahuje 20 m vlevo vpravo.Celý reaktor se skládá z první anaerobní reakční komory a druhé anaerobní reakční komory.V horní části každé anaerobní reakční komory je umístěn třífázový separátor plynu, pevné látky a kapaliny.Třífázový separátor prvního stupně odděluje hlavně bioplyn a vodu, třífázový separátor druhého stupně hlavně odděluje kal a vodu a přítokový a refluxní kal se mísí v první anaerobní reakční komoře.První reakční komora má velkou schopnost odstraňovat organickou hmotu.Odpadní voda vstupující do druhé anaerobní reakční komory může být dále čištěna, aby se odstranily zbývající organické látky v odpadní vodě a zlepšila se kvalita odpadních vod.